原理：
     蛋白质是两性电解质在一定的PH条件下解离而带电。当溶液的PH大于蛋白质的等电点（PI）时，蛋白质本身带负电，在电场中将向正级移动；当溶液的PH小于蛋白质的等电点时，蛋白质带正电，在电场中将向负极移动；蛋白质在特定电场中移动的速度取决于其本身所带的静电荷的多少，蛋白质颗粒的大小和分子形状、电场强度等。
一、主要仪器设备
1、 DYY-8C电泳仪
2、 DYCZ-24E型电泳槽（垂直板式）
3、 WD-9410平板凝胶真空干燥器（配有抽气速率1升/秒，极限压力6×10-2帕真空泵）
4、 TDL-40B及TGL-16G型高速离心机
5、 分析天平（1/1000）
6、 50微升及100微量加样器
7、 FJ-200高速分散均质机
8、 棕色玻璃真空干燥器及棕色小口瓶等玻璃实验仪器一宗
二、化学试剂及溶液的配制：
1、 主要的化学试剂：
（1） 高纯度丙烯酰胺（Acr）
（2） 高纯度N，N-亚甲基双丙烯酰胺（Bis）
（3） 三羟甲基氨基甲烷（Tris）纯度≧99、5%
（4） 十二烷基硫酸钠（SDS）
（5） 过硫酸铵（AP）
（6） N，N，N’，N’-四甲基乙二胺（TEMED）
（7） 溴酚蓝
（8） 甘氨酸（GLY）
（9） 考马斯亮蓝R250或考马斯亮蓝G250
（10） 冰醋酸   AR
（11） 甲醇     AR
（12） 甘油     AR
（13） 无水乙醇 AR
（14） 琼脂糖   CR
（15） 盐酸     AR
2、 溶液的配制： 
（1） 30%丙烯酰胺贮存液：
Acr：3g，Bis：0、08g，先加8ml去离子水溶解，最后定容至10ml
（2）分离胶缓冲液（1、5mol/l   Tris-Hcl  PH8、8）
Tris：1、815g，先加8ml去离子水溶解后，再用浓盐酸调PH8、8，定容至10ml
（3）浓缩胶缓冲液（0、5mol/l  Tris-Hcl  PH6、8）
Tris：0、6g，先加6ml去离子水溶解后，再用浓盐酸调PH6、8，最后定容至10ml
      （4）电极缓冲液（PH8、3）
Tris：6g，GLY：28、8g，SDS：1g，加去离子水并定容至1000ml .
（5）10%（W/V）十二烷基硫酸钠（SDS） 
 在10ml容量瓶中，称取1gSDS，加水溶解后定容至10ml
（6）10%（W/V）过硫酸铵（AP）（现用现配）
 称取1gAP置于10ml棕色容量瓶中，加水溶解后定容至10ml
（7）1%TEMED
量取0、1mlTEMED加水溶解后定容至10ml
（8）0.1%溴酚蓝
 称取0、01g溴酚蓝加水溶解后定容至10ml
（9）样品溶解液
 量取0、5mol/lTris-Hcl（PH6、8）1、25ml，50%甘油4ml，10%SDS2ml，
 0．1%溴酚蓝2ml，加水定容至10ml。
（10）固定液：
 甲醇：水：冰醋酸=2：7：1 （V/V）
（11）染色液：
 称取0.5g考马斯亮蓝G250，溶解在200ml混合溶液中（甲醇：
 水：冰醋酸=9：9：2  V/V）。
（12）脱色液
 甲醇：水：冰醋酸=9：9：2  （V/V）
三、实验步骤：
1 在实验前应将凝胶板及试样格用洗洁精清洗干净，最后用去离子水冲洗三遍，使其自然风干备用。
2 将带有板条的长玻璃板与“凹”形玻璃板在板条处用1%琼脂糖粘牢，然后将其小心地放入底边放有密封条的制胶架内，再垫上1-2块有机玻璃板（一薄一厚），向制胶架底部方向压紧两块玻璃板，同时用4个铁夹子将制胶板与制胶架紧紧地夹在一起备用。
31.5mm板厚10%分离胶的配制
将6ml30%丙烯酰胺储备液，4.5ml分离胶缓冲液 （1.5MOL/LTris-HCL PH8.8），0.18ml 10%SDS，0.12ml 10%AP，6ml水，2.4ml 1%TEMED依次加入到50ml的干净鸡心瓶内混匀，立即灌胶，一直灌到距试样格（梳子）1cm处为止，再小心地在分离胶的上部注入2-3mm高的正丁醇，以使胶面平整。
1.5mm板厚4.8%浓缩胶的配制：
待分离胶聚合后，应将胶顶部的正丁醇倒出并用去离子冲洗三遍，
用滤纸条轻轻吸去残余的水，同时按以下配方制备5ml的浓缩胶：1.6ml 30%丙烯酰胺储备液，1.25ml浓缩胶缓冲液（0.5MOL/L TRIS-HCL PH6.8，），0.1ml 10%SDS，0.1ml10%AP，4.95ml去离子水，最后加入2ml 1%TEMED，立即混匀后用长滴管吸取约3ml小心地加到分离胶的上面，马上插入样品格（梳子），待浓缩胶聚合后，小心地拔出样品格，并用电极缓冲液冲洗样品凹槽（加样孔）数次，以除去未聚合的丙烯酰胺，将制好的玻璃胶板安装到垂直式电泳槽内（凹面向里），并用斜面塑料框将玻璃胶板紧紧地塞牢， 在上下电泳槽中加入足量的电极缓冲液。
5、上样：
 在1ml的样品瓶分别加入50微升样品提取液及50微升样品溶解液，混匀后用微量进样器将30微升的样品混和液加到预先编好号的凝胶加样孔底部，每加入一种样品，应在下槽中洗涤微量进样器数次，以防交叉污染，最后在空白加样孔中加入等体积的样品溶解液。以加热（100℃）与不加热两个样品的提取液为标准。
6、电泳
装好冷凝水系统，上槽接负极，下槽接正极，打开电泳仪电源开关，初始电压调在100-120V，电流控制在15-20mA，当样品中的溴酚蓝指示剂到达分离胶之后，将电压调至200-220V，大约1小时左右，当溴酚蓝到达分离胶底部1cm处，关掉电泳仪电源，停止电泳。
7、固定
从电泳槽上卸下玻璃胶板，轻轻撬开玻璃板，将胶面与凹形玻璃板分开，将胶板放入盛有固定液 的小搪瓷盘中浸泡，直至染料由兰色变为浅黄色为止。
 8、染色
除去固定液，加入0.25%考马斯亮蓝染色液过夜。
9脱色
回收染色液，用蒸馏水把胶面漂洗三次，然后加入脱色液进行扩散脱色，期间更换脱色液4-5次，使蛋白质谱带清晰可见为止。
10凝胶板的保存
1﹚ 湿法
浸泡在保存液中（水：甘油：冰醋酸=100：10：7   V／V  ）
2﹚ 干法
利用平板凝胶真空干燥器进行抽真空干燥，干燥后的凝胶片，编好号码放入棕色玻璃真空干燥器中保存。
  四、结果判断
  以加热（100℃）与不加热（生组织）的样品提取液所跑的凝胶板图谱为标准，比较处理前后待测样品蛋白质电泳图谱的变化及感官判断来判定样品蛋白质在加工处理过程中变性程度。
附注：
样品提取液的制备，将待检测的样品均分两份，将其中一份样品置100℃蒸汽中加热，当样品中心温度达70℃时，维持一分钟，自然冷却后备用，两份样品各取10克分别置于两个100ml带螺旋盖的聚乙烯离心管中，各加入去离子水50ml,都高速均质 3分钟，高速离心10分钟，各取上清液备用。