我们平时食用的食品可能会出现如下几个污染因素：农药、脂肪酸甲酯(FAMEs)、兽药、霉菌毒素、包装污染、食品添加剂、重金属等。触目惊心的字眼，让人们开始寻找有效的解决办法。
    就像检测兴奋剂一样，研究人员对于这些 “食品毒素”的检测必须运用科技手段。
    农药是用在水果蔬菜上常见的有害物质，但有些农药属于无色无味，用肉眼和嗅觉根本觉察不出。气相色谱、液相色谱、气-质联用仪和液-质联用仪被广泛用于蔬菜、水果农药残留的筛查中，以检查产品中是否含有禁用的农药。这些仪器不但可以快速检测出食品里是否含有农药，而且还能反映出是哪种农药，含量多少。
    为了保持食品的新鲜，使用食品添加剂是卖家惯用的方法，这些食品添加剂会提升食品的颜色、外观和味道，但它毕竟是化学物质，会对人体带来健康威胁，现在有一种技术可以分解出食品中的添加剂，并让食物达到可食用标准。
    而霉菌毒素是自然产生的毒素，它污染了食品，从而导致食品的不安全。现在已有法规严格规定食品中霉菌毒素的限量。
    微量的金属元素是食品中重要营养成分，但是高含量或某些重金属则是有毒的。食品中的重金属主要是因为天然或是被污染导致的，如在一些鱼和贝类食品中曾发现含有高毒性的甲基汞。针对这种食品 “杀手”，液-质联用仪可以检测出它们的影踪，并能测出重金属的元素及其形态。
    在检测过程中，有些化学物质是非常容易挥发的，这时候就要利用仪器的冷处理来进行分解，从而检测出食品里的 “毒素”。但遇到不易挥发的化学成分时，将使用加热检测法，可更快提取食品中的有害物质。
    也有不使用仪器就可以进行食品安全检测的，甲醛是一种毒性较强、能破坏生物细胞蛋白的物质，可引起人体过敏、肠道刺激反应、食物中毒等疾患。一般用于腐竹、粉丝等水发性食品里，但只需两滴甲醛检测试剂后，就能知道食品里是否含有甲醛，首先取出1ml水发产品的浸泡液放入离心管中，滴加2滴甲醛检测试剂后，若样品呈现橙红色、浅红色均为有甲醛，没有颜色变化则是无甲醛的表现。